2026日本足球聯賽盃(JFL Cup)是為配合日本足球全面轉向跨年賽製而特別設立的一項賽事，僅在2026年舉辦一次，參賽隊伍為參加日本足球聯賽的 16 支球隊。比賽分為第一階段(分區聯賽)和第二階段(排名賽)進行。

第一階段(分區聯賽)：賽事採用分東區(A組)、西區(B組)兩個組，每個組 8 支球隊，將進行7輪比賽。小組賽階段的比賽與其他賽事的積分計算方式有所不同，如雙方在 90 分鐘常規時間結束時取勝，則勝方獲得 4 分，負方 0 分。如雙方在 90 分鐘常規時間結束時戰平，則直接進入點球大戰來決出勝負者，點球大戰勝方獲得 2 分，負方獲得 1 分。最後以積分多寡來排名次序，若積分相同則按順序比較雙方的淨勝球數、總進球數、雙方對賽成績、在90分鐘常規時間結束時獲勝場次、抽籤(僅用於判定第一、二名)來決定名次。各小組前兩名的球隊晉級排名賽階段的比賽。

第二階段(排名賽)：將根據第一階段的排名進行同名次交叉對陣，即：東區第 1 名 vs 西區第 1 名(冠軍爭奪戰，勝者為冠軍，敗者為亞軍)；東區第 2 名 vs 西區第 2 名(季軍爭奪戰，決定第 3、4 名)；排名賽採用主客場兩回合淘汰製，兩回合總進球數多者獲得更高的最終排名。若兩回合總比分持平，將進行 30 分鐘加時賽，若仍戰平則通過點球大戰決出勝負。