2026亞洲運動會男子足球比賽因為受到 伊拉克隊 退賽影響，總參賽隊伍由 16 支減至 15 支，使得小組分組與晉級規則與原本的規劃有所不同。
本屆男足晉級規則不採取「擇優小組第三名」的機制： 每個小組的前兩名（A、B、C、D組共 8 支球隊）直接出線，晉級的 8 支球隊直接進入八強賽（半準決賽）。

小組賽積分計算：勝一場：得 3 分；和局：得 1 分；負一場：得 0 分。

隊伍同分比序規則（排名優先順序），當小組賽結束後，若有兩支或以上隊伍積分相同，將依據亞洲奧林匹克理事會（OCA）與賽事規範，依序比較以下項目排定座次：
1、相互對戰結果：同分隊伍之間的比賽積分、得失球差、總進球數；
2、小組賽總得失球差：該隊在小組賽所有比賽中的總淨勝球；
3、小組賽總進球數：該隊在小組賽所有比賽中的總入球數；
4、公平競賽積分：依紅黃牌扣分系統決定（黃牌、兩黃變一紅、直紅等扣分少者優先）；
5、抽籤：若以上完全相同則由官方抽籤決定。

淘汰賽階段，比賽將採取「一場定生死」的單敗淘汰制。如果兩隊在 90 分鐘常規時間（含傷停補時）結束後仍踢成平手，則必須進行加時賽，加時賽比賽時間全長 30 分鐘，分為上、下半場各 15 分鐘。如果兩隊在完成 30 分鐘的加時賽後依舊打成平手，將通過點球大戰決定勝負。